Процессы, протекающие в тонкой системе и сознании человека при сахаджа-медитации, весьма специфичны и не имеют места при иных современных медитативных методиках. Используя большое количество тонкой энергии, в обычном режиме расходуемой на непрерывную генерацию мыслей, энергия Кундалини, следуя за вниманием йога (именно поэтому внимание направляется в самую верхнюю чакру), поднимается по позвоночному столбу и наполняет своей энергией симпатическую, парасимпатическую и центральную нервные системы медитирующего. В итоге основные тонкоэнергетические центры (чакры) и вся нервная система в целом получают значительную энергоподзарядку , а энергетическая грязь в чакрах вычищается . Благодаря этому процессу нервная система приходит в состояние баланса